牙髓治疗是在细小的髓腔根管系统内进行的，如果不借助工具，口腔医师很难看清髓底的细微结构，亦无法看到根管内的情况，主要依据其手感和经验进行“盲”操作。而手术显微镜可以显著改善和提高口腔医师的观察能力，使其能够看到髓腔根管系统的细微结构，确保更加精确地治疗。
手术显微镜的作用
放大
手术显微镜可以提供2～20倍之间的不同放大倍率，确保口腔医师可以清晰地观察到髓腔根管系统的细节并进行准确的操作。
照明
良好的照明可以增强人眼睛对物体的分辨力。手术显微镜光源的光线通过光纤传导，亮度较高，汇聚程度较好，并且与术者视线同轴。
防疲劳
手术显微镜的设计及使用均符合人体工程学原理，有助于口腔医师在治疗中保持良好的操作体位，可以让其肩颈肌肉均处于放松的状态，即使长时间操作也不易疲劳。
临床影像资料采集
手术显微镜可以通过适配器连接照相机或摄像机，在治疗过程中同步采集相关的影像资料，也可以对临床操作进行同步转播或远程显示，有利于医患沟通、同行交流及教学 。
手术显微镜在牙髓治疗中的用途
临床诊断
隐裂患牙其裂纹深度对于预后判断至关重要。使用手术显微镜并辅以染色，能够观察牙面裂纹延伸的位置，为预后判断及治疗方案提供依据。
常规根管治疗
对于常规根管治疗而言，从开髓开始就应该使用手术显微镜。微创的操作有助于保留更多的冠部牙体组织。
根管再治疗
在手术显微镜下进行根管再治疗，有助于口腔医师更好地寻找根管治疗失败的原因并加以解决。确保根管内原充填物的彻底去除。
根管治疗缺陷的处理
当根管内有器械分离时，如果没有手术显微镜的帮助，口腔医师想取出器械无疑较困难且风险较大。髓底或根管系统发生穿孔后，在显微镜下能够准确判断穿孔的位置、大小，并使用三氧化矿物盐聚合物（MTA）进行修补。
显微根尖手术
口腔医师在根尖手术中使用显微镜及配套的显微手术器械，能够准确地进行根尖切除、根管倒预备，并用MTA进行根管倒充填，对根管峡部等复杂的解剖结构进行处理，显著提高了根尖手术的成功率。
牙髓治疗是在狭小空间中进行的操作，手术显微镜可以为医师提供充足的照明、清晰放大的视野，确保医师精确地进行牙髓治疗。手术显微镜可以用于牙髓治疗的各个环节。